Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARF3P61204 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARF3P61204 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARF3P61204 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARF3P61204 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARF3P61204 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARF3P61204 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARF3P61204 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARF3P61204 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARF3P61204 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARF3P61204 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARF3P61204 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARF3P61204 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARF3P61204 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARF3P61204 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARF3P61204 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF3P61204 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF3P61204 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARF3P61204 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARF3P61204 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARF3P61204 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ARF3P61204 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARF3P61204 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF3P61204 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF3P61204 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF3P61204 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF3P61204 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ARF3P61204 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF3P61204 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF3P61204 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF3P61204 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF3P61204 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF3P61204 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF3P61204 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARF3P61204 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF3P61204 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF3P61204 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF3P61204 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARF3P61204 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF3P61204 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF3P61204 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF3P61204 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARF3P61204 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF3P61204 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF3P61204 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF3P61204 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF3P61204 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF3P61204 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARF3P61204 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF3P61204 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF3P61204 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF3P61204 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARF3P61204 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARF3P61204 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARF3P61204 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARF3P61204 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF3P61204 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF3P61204 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF3P61204 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF3P61204 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARF3P61204 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARF3P61204 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARF3P61204 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARF3P61204 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARF3P61204 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARF3P61204 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARF3P61204 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ARF3P61204 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARF3P61204 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF3P61204 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF3P61204 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF3P61204 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF3P61204 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ARF3P61204 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF3P61204 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF3P61204 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF3P61204 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF3P61204 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARF3P61204 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF3P61204 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF3P61204 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF3P61204 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF3P61204 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF3P61204 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARF3P61204 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARF3P61204 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF3P61204 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF3P61204 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF3P61204 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF3P61204 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARF3P61204 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF3P61204 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF3P61204 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF3P61204 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF3P61204 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF3P61204 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARF3P61204 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF3P61204 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF3P61204 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ARF3P61204 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.6 ms