Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CLDN15P56746 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN15P56746 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN15P56746 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLDN15P56746 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms