Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
AIF1P55008 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
AIF1P55008 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
AIF1P55008 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AIF1P55008 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AIF1P55008 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
AIF1P55008 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AIF1P55008 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AIF1P55008 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AIF1P55008 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
AIF1P55008 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AIF1P55008 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
AIF1P55008 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
AIF1P55008 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
AIF1P55008 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AIF1P55008 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AIF1P55008 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AIF1P55008 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
AIF1P55008 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AIF1P55008 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AIF1P55008 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AIF1P55008 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
AIF1P55008 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
AIF1P55008 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
AIF1P55008 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AIF1P55008 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
AIF1P55008 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AIF1P55008 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
AIF1P55008 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AIF1P55008 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AIF1P55008 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
AIF1P55008 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AIF1P55008 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AIF1P55008 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
AIF1P55008 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AIF1P55008 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AIF1P55008 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AIF1P55008 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AIF1P55008 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AIF1P55008 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AIF1P55008 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AIF1P55008 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
AIF1P55008 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AIF1P55008 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AIF1P55008 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AIF1P55008 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AIF1P55008 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AIF1P55008 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AIF1P55008 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AIF1P55008 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AIF1P55008 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
AIF1P55008 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AIF1P55008 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
AIF1P55008 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
AIF1P55008 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AIF1P55008 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AIF1P55008 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AIF1P55008 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
AIF1P55008 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AIF1P55008 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AIF1P55008 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AIF1P55008 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AIF1P55008 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AIF1P55008 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AIF1P55008 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AIF1P55008 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AIF1P55008 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AIF1P55008 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AIF1P55008 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AIF1P55008 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AIF1P55008 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AIF1P55008 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AIF1P55008 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AIF1P55008 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AIF1P55008 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AIF1P55008 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AIF1P55008 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AIF1P55008 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AIF1P55008 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AIF1P55008 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AIF1P55008 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AIF1P55008 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AIF1P55008 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AIF1P55008 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms