Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB1P54762 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB1P54762 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB1P54762 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EPHB1P54762 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms