Protein–RNA interactions for Protein: P53805

RCAN1, Calcipressin-1, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN1P53805 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCAN1P53805 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCAN1P53805 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCAN1P53805 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RCAN1P53805 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RCAN1P53805 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms