Protein–RNA interactions for Protein: P42772

CDKN2B, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor B, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2BP42772 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDKN2BP42772 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDKN2BP42772 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDKN2BP42772 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDKN2BP42772 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms