Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA7P36544 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CHRNA7P36544 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CHRNA7P36544 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms