Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP1P29466 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CASP1P29466 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP1P29466 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP1P29466 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP1P29466 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CASP1P29466 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP1P29466 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CASP1P29466 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP1P29466 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP1P29466 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP1P29466 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP1P29466 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CASP1P29466 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP1P29466 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CASP1P29466 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CASP1P29466 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP1P29466 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP1P29466 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CASP1P29466 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP1P29466 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CASP1P29466 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP1P29466 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP1P29466 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CASP1P29466 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP1P29466 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP1P29466 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP1P29466 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP1P29466 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP1P29466 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP1P29466 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP1P29466 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CASP1P29466 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP1P29466 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CASP1P29466 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP1P29466 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP1P29466 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP1P29466 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP1P29466 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP1P29466 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CASP1P29466 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP1P29466 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP1P29466 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP1P29466 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CASP1P29466 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP1P29466 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP1P29466 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP1P29466 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP1P29466 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP1P29466 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP1P29466 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CASP1P29466 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CASP1P29466 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP1P29466 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP1P29466 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CASP1P29466 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP1P29466 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CASP1P29466 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP1P29466 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP1P29466 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CASP1P29466 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP1P29466 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CASP1P29466 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP1P29466 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP1P29466 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CASP1P29466 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP1P29466 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP1P29466 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CASP1P29466 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CASP1P29466 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CASP1P29466 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP1P29466 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP1P29466 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP1P29466 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP1P29466 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP1P29466 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CASP1P29466 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CASP1P29466 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CASP1P29466 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP1P29466 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP1P29466 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CASP1P29466 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP1P29466 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP1P29466 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP1P29466 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP1P29466 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP1P29466 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP1P29466 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP1P29466 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CASP1P29466 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP1P29466 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP1P29466 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP1P29466 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP1P29466 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP1P29466 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP1P29466 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CASP1P29466 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP1P29466 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP1P29466 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CASP1P29466 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.6 ms