Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD1CP29017 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD1CP29017 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD1CP29017 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD1CP29017 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD1CP29017 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD1CP29017 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD1CP29017 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD1CP29017 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD1CP29017 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD1CP29017 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD1CP29017 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD1CP29017 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD1CP29017 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD1CP29017 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD1CP29017 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD1CP29017 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD1CP29017 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD1CP29017 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD1CP29017 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD1CP29017 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD1CP29017 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD1CP29017 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD1CP29017 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD1CP29017 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD1CP29017 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD1CP29017 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD1CP29017 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD1CP29017 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD1CP29017 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD1CP29017 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD1CP29017 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CD1CP29017 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD1CP29017 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD1CP29017 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD1CP29017 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD1CP29017 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD1CP29017 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CD1CP29017 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD1CP29017 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD1CP29017 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD1CP29017 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD1CP29017 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD1CP29017 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD1CP29017 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD1CP29017 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD1CP29017 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CD1CP29017 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD1CP29017 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD1CP29017 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD1CP29017 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD1CP29017 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD1CP29017 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD1CP29017 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1CP29017 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1CP29017 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1CP29017 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1CP29017 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1CP29017 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1CP29017 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1CP29017 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD1CP29017 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD1CP29017 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD1CP29017 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD1CP29017 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD1CP29017 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD1CP29017 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD1CP29017 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD1CP29017 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD1CP29017 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD1CP29017 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD1CP29017 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD1CP29017 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CD1CP29017 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CD1CP29017 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1CP29017 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD1CP29017 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD1CP29017 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD1CP29017 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD1CP29017 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD1CP29017 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD1CP29017 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD1CP29017 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD1CP29017 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD1CP29017 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD1CP29017 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD1CP29017 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD1CP29017 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD1CP29017 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms