Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2A2P16615 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2A2P16615 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP2A2P16615 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms