Protein–RNA interactions for Protein: P13473

LAMP2, Lysosome-associated membrane glycoprotein 2, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP2P13473 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LAMP2P13473 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
LAMP2P13473 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMP2P13473 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMP2P13473 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms