Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM49CP0CI26 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM49CP0CI26 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM49CP0CI26 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRIM49CP0CI26 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM49CP0CI26 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms