Protein–RNA interactions for Protein: P08134

RHOC, Rho-related GTP-binding protein RhoC, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOCP08134 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RHOCP08134 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOCP08134 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOCP08134 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOCP08134 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RHOCP08134 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RHOCP08134 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOCP08134 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RHOCP08134 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOCP08134 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOCP08134 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOCP08134 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOCP08134 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RHOCP08134 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOCP08134 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOCP08134 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RHOCP08134 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOCP08134 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOCP08134 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOCP08134 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RHOCP08134 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOCP08134 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOCP08134 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOCP08134 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOCP08134 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RHOCP08134 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOCP08134 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOCP08134 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOCP08134 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RHOCP08134 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOCP08134 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOCP08134 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RHOCP08134 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOCP08134 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOCP08134 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RHOCP08134 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOCP08134 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOCP08134 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RHOCP08134 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOCP08134 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOCP08134 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOCP08134 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RHOCP08134 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOCP08134 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOCP08134 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOCP08134 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOCP08134 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOCP08134 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RHOCP08134 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOCP08134 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOCP08134 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOCP08134 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOCP08134 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOCP08134 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RHOCP08134 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOCP08134 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOCP08134 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOCP08134 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOCP08134 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RHOCP08134 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RHOCP08134 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOCP08134 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOCP08134 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOCP08134 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOCP08134 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RHOCP08134 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOCP08134 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RHOCP08134 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOCP08134 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOCP08134 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOCP08134 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RHOCP08134 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOCP08134 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOCP08134 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RHOCP08134 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOCP08134 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RHOCP08134 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOCP08134 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOCP08134 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RHOCP08134 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOCP08134 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOCP08134 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RHOCP08134 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOCP08134 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOCP08134 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RHOCP08134 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOCP08134 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOCP08134 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOCP08134 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOCP08134 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOCP08134 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RHOCP08134 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms