Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ITGAVP06756 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ITGAVP06756 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ITGAVP06756 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ITGAVP06756 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ITGAVP06756 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms