Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ITGB3P05106 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB3P05106 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ITGB3P05106 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ITGB3P05106 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB3P05106 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms