Protein–RNA interactions for Protein: P04264

KRT1, Keratin, type II cytoskeletal 1, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT1P04264 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT1P04264 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT1P04264 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT1P04264 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT1P04264 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT1P04264 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT1P04264 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT1P04264 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT1P04264 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT1P04264 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT1P04264 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT1P04264 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT1P04264 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT1P04264 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT1P04264 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT1P04264 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT1P04264 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT1P04264 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT1P04264 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT1P04264 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT1P04264 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT1P04264 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT1P04264 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT1P04264 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT1P04264 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT1P04264 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT1P04264 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT1P04264 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT1P04264 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT1P04264 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT1P04264 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT1P04264 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT1P04264 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT1P04264 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT1P04264 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT1P04264 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT1P04264 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT1P04264 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT1P04264 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT1P04264 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT1P04264 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT1P04264 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT1P04264 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT1P04264 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT1P04264 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT1P04264 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT1P04264 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT1P04264 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT1P04264 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT1P04264 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT1P04264 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT1P04264 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT1P04264 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT1P04264 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT1P04264 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT1P04264 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT1P04264 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT1P04264 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT1P04264 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT1P04264 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT1P04264 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT1P04264 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT1P04264 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT1P04264 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT1P04264 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT1P04264 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT1P04264 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT1P04264 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT1P04264 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT1P04264 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT1P04264 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT1P04264 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT1P04264 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT1P04264 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT1P04264 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT1P04264 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT1P04264 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT1P04264 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT1P04264 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT1P04264 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT1P04264 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT1P04264 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT1P04264 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT1P04264 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT1P04264 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT1P04264 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KRT1P04264 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT1P04264 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT1P04264 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT1P04264 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT1P04264 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT1P04264 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT1P04264 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT1P04264 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KRT1P04264 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT1P04264 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT1P04264 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT1P04264 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT1P04264 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KRT1P04264 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms