Protein–RNA interactions for Protein: P01601

IGKV1D-16, Immunoglobulin kappa variable 1D-16 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-16P01601 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-16P01601 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-16P01601 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-16P01601 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-16P01601 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-16P01601 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IGKV1D-16P01601 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IGKV1D-16P01601 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
IGKV1D-16P01601 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IGKV1D-16P01601 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IGKV1D-16P01601 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms