Protein–RNA interactions for Protein: P01588

EPO, Erythropoietin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOP01588 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPOP01588 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPOP01588 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPOP01588 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPOP01588 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPOP01588 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPOP01588 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPOP01588 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPOP01588 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EPOP01588 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPOP01588 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPOP01588 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPOP01588 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPOP01588 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPOP01588 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPOP01588 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPOP01588 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPOP01588 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPOP01588 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPOP01588 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPOP01588 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPOP01588 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPOP01588 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPOP01588 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPOP01588 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPOP01588 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPOP01588 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPOP01588 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EPOP01588 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPOP01588 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPOP01588 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPOP01588 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPOP01588 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPOP01588 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EPOP01588 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPOP01588 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPOP01588 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPOP01588 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPOP01588 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPOP01588 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPOP01588 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPOP01588 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPOP01588 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPOP01588 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPOP01588 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPOP01588 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPOP01588 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPOP01588 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPOP01588 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPOP01588 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPOP01588 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPOP01588 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPOP01588 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPOP01588 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPOP01588 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPOP01588 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPOP01588 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPOP01588 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPOP01588 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPOP01588 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPOP01588 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPOP01588 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPOP01588 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPOP01588 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPOP01588 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPOP01588 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPOP01588 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPOP01588 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPOP01588 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPOP01588 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPOP01588 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPOP01588 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPOP01588 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPOP01588 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPOP01588 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPOP01588 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPOP01588 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPOP01588 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPOP01588 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPOP01588 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPOP01588 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPOP01588 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPOP01588 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPOP01588 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPOP01588 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPOP01588 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPOP01588 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EPOP01588 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPOP01588 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPOP01588 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPOP01588 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPOP01588 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPOP01588 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPOP01588 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPOP01588 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPOP01588 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EPOP01588 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPOP01588 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPOP01588 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPOP01588 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms