Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF1O95521 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF1O95521 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF1O95521 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF1O95521 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF1O95521 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF1O95521 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms