Protein–RNA interactions for Protein: O75712

GJB3, Gap junction beta-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB3O75712 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB3O75712 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB3O75712 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB3O75712 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB3O75712 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB3O75712 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB3O75712 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB3O75712 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB3O75712 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB3O75712 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB3O75712 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB3O75712 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB3O75712 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB3O75712 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB3O75712 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB3O75712 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB3O75712 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB3O75712 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB3O75712 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB3O75712 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB3O75712 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB3O75712 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB3O75712 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB3O75712 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB3O75712 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB3O75712 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB3O75712 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB3O75712 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB3O75712 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB3O75712 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB3O75712 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB3O75712 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB3O75712 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB3O75712 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB3O75712 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB3O75712 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJB3O75712 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB3O75712 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB3O75712 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB3O75712 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB3O75712 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GJB3O75712 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB3O75712 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB3O75712 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB3O75712 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB3O75712 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB3O75712 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB3O75712 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJB3O75712 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB3O75712 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB3O75712 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJB3O75712 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB3O75712 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB3O75712 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB3O75712 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB3O75712 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB3O75712 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB3O75712 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB3O75712 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJB3O75712 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB3O75712 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB3O75712 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB3O75712 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB3O75712 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB3O75712 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB3O75712 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB3O75712 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GJB3O75712 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB3O75712 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB3O75712 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJB3O75712 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB3O75712 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB3O75712 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB3O75712 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJB3O75712 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB3O75712 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB3O75712 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB3O75712 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB3O75712 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB3O75712 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB3O75712 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJB3O75712 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB3O75712 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJB3O75712 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB3O75712 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GJB3O75712 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GJB3O75712 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB3O75712 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB3O75712 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB3O75712 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJB3O75712 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms