Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PLIN3O60664 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN3O60664 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLIN3O60664 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLIN3O60664 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms