Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SELENOFO60613 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SELENOFO60613 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SELENOFO60613 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SELENOFO60613 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms