Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MCM3APO60318 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MCM3APO60318 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MCM3APO60318 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MCM3APO60318 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms