Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRRTM2O43300 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LRRTM2O43300 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRTM2O43300 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRTM2O43300 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
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