Protein–RNA interactions for Protein: O43257

ZNHIT1, Zinc finger HIT domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT1O43257 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNHIT1O43257 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNHIT1O43257 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZNHIT1O43257 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZNHIT1O43257 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms