Protein–RNA interactions for Protein: O15068

MCF2L, Guanine nucleotide exchange factor DBS, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2LO15068 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
MCF2LO15068 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCF2LO15068 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MCF2LO15068 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MCF2LO15068 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms