Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.49
PTPRTO14522 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
PTPRTO14522 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRTO14522 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRTO14522 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
PTPRTO14522 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRTO14522 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
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