Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
H3BQV1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
H3BQV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
H3BQV1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
H3BQV1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
H3BQV1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
H3BQV1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
H3BQV1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
H3BQV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
H3BQV1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
H3BQV1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQV1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQV1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQV1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQV1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQV1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQV1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
H3BQV1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BQV1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BQV1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BQV1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BQV1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BQV1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BQV1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
H3BQV1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BQV1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BQV1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BQV1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
H3BQV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
H3BQV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H3BQV1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H3BQV1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H3BQV1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
H3BQV1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
H3BQV1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
H3BQV1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
H3BQV1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
H3BQV1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H3BQV1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H3BQV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
H3BQV1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H3BQV1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H3BQV1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
H3BQV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
H3BQV1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
H3BQV1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BQV1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BQV1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BQV1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BQV1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
H3BQV1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H3BQV1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H3BQV1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
H3BQV1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
H3BQV1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BQV1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BQV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BQV1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BQV1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BQV1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BQV1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BQV1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
H3BQV1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H3BQV1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H3BQV1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
H3BQV1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
H3BQV1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H3BQV1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H3BQV1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
H3BQV1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
H3BQV1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H3BQV1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H3BQV1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H3BQV1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
H3BQV1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
H3BQV1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
H3BQV1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
H3BQV1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
H3BQV1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H3BQV1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
H3BQV1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms