Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B4DGG1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
B4DGG1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DGG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DGG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DGG1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DGG1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DGG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DGG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DGG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DGG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DGG1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DGG1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DGG1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4DGG1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4DGG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4DGG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DGG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DGG1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DGG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms