Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
B4DGG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B4DGG1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B4DGG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B4DGG1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B4DGG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
B4DGG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
B4DGG1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
B4DGG1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B4DGG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DGG1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DGG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DGG1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
B4DGG1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DGG1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DGG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DGG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
B4DGG1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B4DGG1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B4DGG1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B4DGG1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
B4DGG1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DGG1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DGG1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
B4DGG1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4DGG1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4DGG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B4DGG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DGG1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DGG1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
B4DGG1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
B4DGG1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
B4DGG1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms