Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC37A2A6NM11 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC37A2A6NM11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC37A2A6NM11 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC37A2A6NM11 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms