Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRIT2A6NDA9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRIT2A6NDA9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIT2A6NDA9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIT2A6NDA9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms