Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PRAMEF22A3QJZ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
PRAMEF22A3QJZ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PRAMEF22A3QJZ6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
PRAMEF22A3QJZ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms