Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
UBA6A0AVT1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBA6A0AVT1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBA6A0AVT1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBA6A0AVT1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms