Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SETBP1Q9Y6X0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SETBP1Q9Y6X0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
SETBP1Q9Y6X0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
SETBP1Q9Y6X0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SETBP1Q9Y6X0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms