Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCDHB12Q9Y5F1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB12Q9Y5F1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB12Q9Y5F1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB12Q9Y5F1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms