Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAPRE3Q9UPY8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAPRE3Q9UPY8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAPRE3Q9UPY8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAPRE3Q9UPY8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms