Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TTF2Q9UNY4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTF2Q9UNY4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TTF2Q9UNY4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTF2Q9UNY4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TTF2Q9UNY4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.9 ms