Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FZD4Q9ULV1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FZD4Q9ULV1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FZD4Q9ULV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FZD4Q9ULV1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FZD4Q9ULV1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1753.4 ms