Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TPCN1Q9ULQ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TPCN1Q9ULQ1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TPCN1Q9ULQ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TPCN1Q9ULQ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TPCN1Q9ULQ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TPCN1Q9ULQ1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPCN1Q9ULQ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TPCN1Q9ULQ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TPCN1Q9ULQ1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
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