Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF490Q9ULM2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF490Q9ULM2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF490Q9ULM2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZNF490Q9ULM2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms