Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ASIC3Q9UHC3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ASIC3Q9UHC3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ASIC3Q9UHC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ASIC3Q9UHC3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC3Q9UHC3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms