Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
MIS18AQ9NYP9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
MIS18AQ9NYP9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MIS18AQ9NYP9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MIS18AQ9NYP9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MIS18AQ9NYP9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MIS18AQ9NYP9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms