Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TMOD3Q9NYL9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
TMOD3Q9NYL9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
TMOD3Q9NYL9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
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TMOD3Q9NYL9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
TMOD3Q9NYL9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TMOD3Q9NYL9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
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