Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MED29Q9NX70 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED29Q9NX70 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED29Q9NX70 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED29Q9NX70 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms