Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRAK4Q9NWZ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRAK4Q9NWZ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRAK4Q9NWZ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms