Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SNX15Q9NRS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SNX15Q9NRS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX15Q9NRS6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX15Q9NRS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX15Q9NRS6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms