Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TULP4Q9NRJ4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TULP4Q9NRJ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TULP4Q9NRJ4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
TULP4Q9NRJ4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TULP4Q9NRJ4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TULP4Q9NRJ4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms