Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPCPD1Q9NPB8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GPCPD1Q9NPB8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GPCPD1Q9NPB8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GPCPD1Q9NPB8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
GPCPD1Q9NPB8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms