Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CCSER1Q9C0I3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCSER1Q9C0I3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCSER1Q9C0I3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCSER1Q9C0I3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCSER1Q9C0I3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCSER1Q9C0I3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CCSER1Q9C0I3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CCSER1Q9C0I3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCSER1Q9C0I3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCSER1Q9C0I3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
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