Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR1Q9C0D0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR1Q9C0D0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHACTR1Q9C0D0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHACTR1Q9C0D0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms